據臺灣《中國時報》報道，國民黨榮譽主席連戰的妻子連方瑀日前公開表示，當年搶救兒子連勝文槍傷的醫生不包括柯文哲，引發爭議。連勝文陣營執行副總干事周守訓18日表示，不管是動刀的人，或在幕后運籌帷幄的人，連勝文與連戰夫婦都很感謝，“包括柯文哲在內”。

　　連勝文的父母親連戰、連方瑀16日首度“合體”站臺，賣力替參選臺北市長的兒子助選。連方瑀在活動中說，4年前連勝文遭槍擊，她很感謝4位臺大醫師救了兒子的命，但她強調，柯文哲沒有在里面，因為柯說自己是“墨綠”，要是連勝文有三長兩短，人家會說他是動手腳。

　　時任醫療團隊成員、不愿具名的臺大醫院醫師表示，手術房內主要醫師僅6人，并未包含柯；哪位醫生付出多，病患家屬看得最清楚，否則連方瑀不會出來說明。不過，另一參與醫療的臺大醫師則認為，柯文哲在連勝文就醫的過程中像是“總召集人”。

　　柯文哲的妻子陳佩琪17日在臉書上反駁，強調連勝文出院后，柯文哲辦公室收到兩瓶紅酒，上面署名的就是連戰夫婦。

　　對此，連戰表示，送柯文哲紅酒是禮貌性致意，連方瑀感謝的是在開刀房里不眠不休的醫護人員。

　　柯文哲18日說，家屬或病人送一個小禮物給醫生，送的人是表示感謝，收的人是高興病人恢復健康，“本來就是美事一樁，人情世故，何必搞成這樣？”

　　柯文哲強調，紅酒也不是只有他一個人收，應該是所有參與救治的人都有收，“我猜連護理長也有”。

　　對于臺北市議員李新公開表示，槍擊案發生當時，臺大醫院院長曾打電話給柯文哲，柯文哲卻不愿意進急診室。柯文哲說，這通電話全世界只有兩個人知道，“一個是我，一個是院長，李新是知道什么！”“他(李新)是‘國安局’竊聽小組的組長嗎？我實在是不太高興！”